Los cambios en el genotipo son producidos mediante mutación y por recombinación genética.
Mutación: es un cambio heredable en la secuencia de bases de los ácidos nucleicos contenidos en el genoma de un organismo.
Recombinación genética: es el proceso por el cual los elementos genéticos contenidos en dos genomas separados se juntan en uno solo.
Mientras que la mutación conlleva sólo una pequeña cantidad de cambios genéticos en una célula, la recombinación genética normalmente conlleva cambios más grandes ya que pueden transferirse entre organismos genes, conjunto de genes e incluso cromosomas enteros.
En el pasado prácticamente no existían procedimientos para conseguir la recombinación genética en cepas de producción industrialmente importantes, de forma que el espectacular éxito del desarrollo de cepas en la industria se debe básicamente a la aplicación extensiva de la mutación y selección.
Las mutaciones pueden ocurrir espontáneamente o después de la inducción con agentes mutagénicos. Las mutaciones espontáneas pueden ocurrir debido a la acción de las radiaciones naturales e incluso durante la replicación del DNA debido a errores en la lectura de las bases.
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